Первые работы в этой части Антарктиды были проведены ещё в 70-х годах прошлого века. В то время ещё никто не догадывался, что здесь под толщей льда скрыто озеро, размеры которого сопоставимы с Байкалом. Доказать его существование удалось только в середине 1990-х годов. Тогда же ученые пробурили порядка 3км льда, но было принято решение остановиться, чтобы избежать загрязнения. Бурение возобновили в 2005 году.

Специалисты предполагают, что озеро «Восток» находится в изоляции от земли на протяжении последних 5-30 млн лет. Поэтому можно ожидать, что здесь скорее всего сохранился уникальный биоценоз. На данный момент удалось обнаружить только один ранее неизвестный вид термофилов.